A Águia de Bonelli distribui-se de forma escassa e irregular pela região paleártica (Arroyo et al, 1995). Pode ser encontrada em países europeus como Albânia, Croácia, Chipre, França, Grécia, Itália, Turquia, Portugal e Espanha.

É nestes dois últimos que se encontram os efectivos populacionais mais importantes com 84-94 casais (Palma et al, 1998) e 679-755 casais (Arroyo et al, 1995), respectivamente. Em conjunto com Marrocos, a Península Ibérica partilha as populações mais substanciais do Paleártico Ocidental (Arroyo et al, 1992).

    Actualmente pensa-se que existam entre 938 a 1.039 casais em toda a Europa, com uma clara regressão em todos os países (Real et col., 1996a 1996b). Em Portugal, a população distribui-se por dois núcleos densos de maior importância, no sul e no nordeste do país, encontrando-se dispersa e fragmentada pelo restante território.
A população de Águia de Bonelli do Nordeste de Portugal foi estimada, no ano de 1999, em cerca de 30 casais reprodutores (Fráguas, 1999). Actualmente existem, aproximadamente, 23 casais representando uma taxa de decréscimo de 28 a 30 % em apenas 9 anos. 

Mapa de distribuição mundial de Águia de Bonelli Hieraaetus Fasciatus