As populações da Europa são migradoras existindo um núcleo no Sul de Espanha onde algumas cegonhas pretas permanecem durante o inverno. Esta espécie pode ser observada no nosso país desde meados de Fevereiro até meados de Setembro.
Na época de invernada as populações Europeias migram para África sub-sariana, para Este e Nordeste de África. No caso da população ibérica grande parte dos indivíduos migra para África ocidental (Del Hoyo et al. 1992; Wetlands International 2002).

Mapa com as principais rotas de migração da Cegonha preta |